到3月份了stO
感觉写太长也不太好所以新开一篇!(主要是用Gridea这个自带的编辑器只能说好用程度一般...
另外就是换了个更符合这东西定位的标题(
刚好看到5月要发ppp的全live合集box(虽然买不起)就选了这个头图(
3.1 总之是周六所以上午就没来(
(srds昨天晚上吃完饭就直接回宿舍打游戏了同样没来工位
(然而最近确实没有太多事情要做
今天仍然在跑AIMD(服务器占得好满...
也得开始看下周的论文了(
Liu, S., Lu, Y., Yu, C. et al. Triple-junction solar cells with cyanate in ultrawide-bandgap perovskites. Nature 628, 306–312 (2024). https://doi.org/10.1038/s41586-024-07226-1
晚上被约出去吃然而到了8点还没下文stO估计就这个时候跑路了吧(
3.2 出去玩了一天(上午去了雍和宫下午去了什刹海
雍和宫感觉太佛教了(不太适应
总之拜了很多佛希望有用
上下午都好多人stO晚上就在宿舍打了一晚上游戏
3.3 该工作了.jpg
在高通量筛选苯环基材料的代码路径中,输入nohup python check_rm.py &,这里这个命令提交失败了,检查一下
疑似是网不好(新要求是需要mol文件和统计数量
上次的任务还剩多少个材料没有被筛选掉?总结好了吗,剩下的再发给我
总之根据微信记录改吧(
别忘了看论文!(以及这周五组会的AIMD的ppt
(以及昨天立了剪一个新的Overture的Flag
下午真是不一般地颓废...一直在剪视频...晚上至少把xf师姐的任务和AIMD的ppt做完(
总之算是做完了(?之后应该还要检查一次吧...
明天再检查一次xf师姐微信看看筛选情况好了(以及还有几个要重新算的
以及还要看论文看论文!!!记得要做个ppt的stO
(别整天想泥那Overture了
3.4 上午过来剪了一上午视频(终于只差最后一段了
然后到了中午才发现原来没登微信其实来了一堆问题(还好好像没新事
下午先看论文!!!(然而还是先把视频剪完了
评价还可以(首先感谢祺写佬和远见佬捧场
这周这篇论文感觉好无聊...找不到为什么能上NS的点(这是可以说的嘛
总之今天(勉强)把周五晚上讲的ppt做完了!(感觉后面还得复习...昨天晚上确实睡太少了
明天晚上还要找hc师兄讨论MTP势的问题(不然周五的时候没办法和老师交代
以及今天让师姐看了AIMD的ppt说是最好把能量曲线补一下图(但是今天实在不想动了明天再做吧
应师姐的要求写一下:周五一定要记得提买打印机的事情!!!
3.5 上午总之把ppt的图补完了
下午出去玩(总之又去了ktv
晚上心好累...xf师姐来了巨多任务(下面再细说指整理微信聊天记录
然后是昨天MTP势的问题...总之有几篇文章要看(同时周五之前要能把程序跑起来
暂且扩胞到了1x2x2...80个原子希望没事(感觉不能再扩了
但是程序暂时跑不正确stO明天得看看怎么回事
晚上最后追加:正确了(但明天还是要检查
xf师姐的新任务(们):先把苯环的优化和静态文件夹分割成数个文件夹,每个文件夹里面1000个文件吧,看看这样会不会好些
把算的任务停掉-把所有优化的文件夹里里面的KPOINT换成这个,再把提交脚本改成gam计算,顺便帮我提交一下高通量
又来活了,这个活下周五前干完就行(网页的地方.docx)
你的excel表怎么样了,还剩多少个钉子户(理论上来说不算任务因为程序跑完了...但是想想还得转编码虽然不算太麻烦但是还是咕一下stO
总之郑码了(明天加油吧
3.6 上午在宿舍洗衣服啥也没干(震声
相当地不想面对今天这堆事情...
先写一下MTP这边(总之就是跑起来像是没其他问题但是很慢...据师兄说本来应该是10-20min一个比较合理但是现在的情况是60-90min一个(晚上或者明天问问吧
然后是xf师姐之前苯环的高通量做完了,excel表给她了,之后要把表里的内容稍微重算一下,改INCAR和磁矩
(然而还有那个下周五的活...晚上开始动手吧
晚上是一丁点也不想动...先复习文章吧(
顺便问了一下师姐有没有推荐的适合逛街的地方(恭王府、天坛、地坛...)
结果最后今晚回去地特别早(8点半...
3.7 早上去吃了羊肉粉很少约一起出去吃早餐的...
MTP依然很慢...高通量重跑的部分跑完了才想起来还有初始磁矩要改...
下午的组会顺利度过了QAQ打印机的最后结果是把老师办公室的搬过来...
晚饭去吃了炸酱面(有点咸了
晚上开会没啥新的内容(不过知道了网页的地方这个活似乎要得比较急...
3.8 到了一天的最后才想起来要写...
昨晚熬了一下夜今天早上十点半才起(
下午到工位开始搞网页的地方这个...到晚上搞完了(但感觉之后估计还得返工一下...
高通量改了下INCAR(额外把ISPIN全部打开了)感觉算得不太快了...明天再看结果吧(
今晚和Muon一起去高兴火锅吃了一餐(某重山5点过去取号发现要等2h直接放弃了x很久没吃火锅了感觉还挺好的
明天预计不会来!(思考一下做些什么
3.9 补充一下(虽然确实没做什么事
一觉睡到中午直接吃了前一天买的面包当早餐
晚上出去吃了重庆小面觉得还可以(虽然有点贵
真的没了其余时间在宿舍打了一天游戏...
3.10 上工(然而没什么氛围到下午3点都还没见到一个人...
MTP还在跑且依然很慢(疑似更慢了...
画了一下剩余的算不出来的高通量的因子图然后啥也没发现...
还得给网页的地方写个运行说明(好歹今天写完了
改了一下计算设置之后只剩十几个结构有问题了(感觉可能可以找找规律的样子
看了一个结构感觉优化前后(虽然没成功优化)晶胞大小变化很大
明天或者后天问问xf师姐
3.11 相当无所事事的一天...
MTP正常,hc师兄终于回来了,问了一下意见总之暂时正常(虽然一次project刷新很久...
好摸鱼的一天
然后上午扫了罗小黑日版的台本,中午给了祺写八音盒然后拿到了扫描仪(虽然没啥用)
晚上从班会回来把目前高通量的统计结果发给xf师姐吧(明天改一改计算设置再跑一次
感觉氧化铝那边NEB总得做的...多尝试几种构型吧(讲真AIMD估计之后还得做不同温度...等等甲方那边怎么说
3.12 今天要写一篇推送的样子(别忘了
昨天晚上xf师姐给了个东西要构建构型,包括重新计算
srds服务器今天挤爆了...交不上...调整了一下构型交了NEB好难排队...
晚上检查了一下发现IMAGE数在复制INCAR的时候没改stO今天一天服务器都满得不得了重新计算也没做...
稍微理一下现在要做的事情:高通量,氧化铝,MTP,都要推进(但现在服务器挤爆的情况下也没办法...
结果下午和半个晚上折腾了半天自动剪广告...
晚上又出去吃了一次重庆小面(这一次吃的最便宜的感觉就一般...当奖励自己吃一次贵的还行
最近都有点没太多事情干的倾向...每天看篇文章吧(这要怎么立Flag...因子5以上看点计算钙钛矿相关(?
但今天摸了(不知道一个人的好日子能过到哪一天
3.13 今天上午在宿舍多睡了(起不来
所以中午才到工位(当作每周休息了一天洗衣服吧
但是所以明天早上最好7点起床把衣服洗了...
高通量还在堵着...要不先交上(?
这里算完了,又减少了几种,目前只有6+2=8种了(但明天再发结果好了
xf师姐昨天说网页的地方那里第一步其实是要做的...总之算是做完了(但是又用了selenium...先自己把结果跑出来比较好
srds这个第一步的爬虫实在太慢了...几个小时才能跑出来一种
NEB今天下午发现结构有问题...最后重新调整了结构(但是排不上队了stO
今天随便挑了一篇感觉标题比较神秘的(Language Model-Assisted Machine Learning, Photoelectrochemical, and First-Principles Investigation of Compatible Solvents for a CH3NH3PbI3 Film in Water
虽然说语言模型这个比较高级但是其实似乎做的也就是从语言到分类的模型(总之不是LLM那种
既然研究水溶液中钙钛矿薄膜的相容溶剂,整体就是先利用文章摘要做出溶剂和稳定性的标识符,再做遗传机器学习,再做实验验证以及DFT计算
听起来好缝能缝得说得过去也是本事(
3.14 上午又没来...晚上睡得晚加上早上早早爬起来洗衣服导致困得要死结果就补觉了(
NEB总之正在进行(虽然改了几回INCAR...但是跑出来的结果海星
xf师姐的任务跑完第一步先和她说一声吧(后面估计得过两天再跑
今天下午开组会这个学期要统计一下组里电脑报废情况,以及下周讲讲中期内容和NEB进展(
报销了新显示器!(买回来看看效果如何
今晚去吃了小炒黄牛肉(好吃
3.15 今天居然是315(这有什么好居然的
NEB设置似乎有点问题(但是也只能边交边调整
实在排不上队改成了4个节点先跑起来看看(跑起来了但是好慢
网页的地方这个要弄的也太多了...只能慢慢来(
先发一下程序以及更新一下readme还是算了(感觉扔给xf师姐做这个比自己做还会更花时间...
晚上在想去哪吃...(最后去了火锅自助...只有2两肉但素菜免费吃(爽食
3.16 补一下
下午去了天坛(除了太远了以外还挺适合逛的
晚上逛了超市(被卖了7个蛋挞...软了但是味道还可以,评价是比食堂的好吃(
3.17 又到了周一(
继续跑xf师姐要的东西的脚本...
MTP总之还在算(并且看起来也没有太多进展的样子
服务器空出来了一点所以高通量可以交了(以及NEB可以再交一点
高通量交上了然而进展不大...从7到5(
晚上看看NEB能再怎样建一个模吧(虽然感觉有点问题但是总之弄了个新的
NEB现在还在算...希望不要到1000步(
xf师姐那里交过去了,以及高通量结果也给了(但是还没回怎么搞
晚上又去吃了重庆小面(好贵但应该比麦当劳健康吧...?
以及周五的时候提醒刘老师买新插座!!!
3.18 上午洗衣服中午出去吃了烤肉(吐槽一下)
然后下午在装师姐的新电脑结果拖到现在才写今天第一次...明天至少得看论文了!!!
昨天晚上选的论文是这个:Cation reactivity inhibits perovskite degradation in efficient and stable solar modules
NEB还在算...昨天交的新结构12那个没啥问题10的寄了(
可能10要稳定比较困难...总之另外建了一个12的模型(靠近边界所以处理的时候还要小心
MTP还在算...高通量写了NUPDOWN就不写MAGMOM所以剩下的5个再交一次
xf师姐发了一段非常高深莫测的话...虽然说这个分子的结构晚点发给我但窝现在还没见到...
今天服务器又开始忙起来了(
3.19 又是拖到快走的时候才写日记的一天(但今天早起了可喜可贺
最主要要做的事情是:一是用 gradient boosting regression模型(也可以其他的回归模型),特征选取B位金属原子的元素信息、A位分子的结构信息(RDkit提取)、以及A位分子偶极矩。训练好模型后用SHapley Additive exPlanations分析各个特征的重要性,分子结构文件已经发了(这项不算急
二是周五的时候先汇报一下理解的光吸收系数计算的步骤(这个急
MTP一如既往(但高通量从5个变成了4个也算有进展
论文算是看完了把ppt做了(但是铁定还需要复习的
昨天新建的12的模型也寄了(目前尝试把两个12的模型做一次NEB试试
反正周五要讲这部分了所以明天也得做ppt(以及之前的ppt得改改标题复习一下
以及3.29定了去深圳的机票所以停更几天(虽然这东西根本就没人看吧x
另外今天年级教务发了一个包含了一堆个人家庭去向信息的超大表格然后过了半天才撤回(所以世界是一个巨大的草台班子x
3.20 今天人起床感觉都不太舒服但是还是爬到了工位(
MTP最近都懒得看了(高通量今天服务器爆满啥也交不上...
做了一下明天下午组会要的ppt(然而NEB也交不上甚至频率计算都没办法...
连用来频率计算的都排不上队...
总之晚上紧急复习了一下光催化计算(
3.21 昨天晚上走的时候竟然忘了写...
大概知道了是花粉过敏导致眼睛鼻子痒(但没有办法只能看看能不能买盒氯雷他定
MTP懒得看了(但服务器空出来了
交了频率计算上去之后发现要算巨久...只能慢慢等(然后发现刚好剩下6个节点于是又弄了个NEB上去
下午组会,中期报告得写个稿子并且加一页过渡,NEB计算继续,AIMD这边尝试建一个无真空层的模型(好多
人好难受...啥正事都不想干(但晚上去米村拌饭吃饭了
晚上小会讲文章讲得依托(光吸收系数用PBE?其他步骤没太多问题
四个重算的按微信记录来就行
周末要开始搞机器学习那个东西了(
MTP说是训练到现在其实已经差不多可以了所以任务停了(之后要算些什么还得去问问
3.22 上午洗衣服+摸鱼中午才过来(
NEB设6个点算得实在太慢了...还是改成5个点再算一次
高通量经过各种调整设置后奇迹般地全部算出来了!(所以接下来算DOS
晚上解决DOS的问题比预想中顺利些(改节点数和MAGMOM就全都解决了
算部分电荷密度发现带隙正确的少得离谱...总之没几项加进去的(估计手工看一下也没了
一点都不想写中期报告的稿子...但是没办法(明天晚上还是过来写一下好了
机器学习这个今天没进展啊...明天也要弄(至少尝试跑起来吧
建NEB新模型和界面新模型这个感觉不好拖到周一再做啊(周末服务器比较空
昨天频率的计算也完成了没啥问题stO(总之只有一个虚频)
今晚去买了煎饼果子然后坐在人行天桥(?)上边看桥下的晚高峰边吃完了~~(有种很神经的感觉...)~~
3.23 今天来加班(昨晚和师姐聊了半小时之后发现今天得赶赶进度...
(然后又成了一整天忘记更新...
上午把昨天晚上说的把所有没能优化成功的结构加K点重算的高通量计算交上了(然后下午开始发现一大群人开始交各种计算...排队堪忧
NEB今天居然一直在算...看结构感觉好像还挺正常的(?总之先跑着吧
然后开始弄机器学习的...现在卡在rdkit提取分子特征这步(正在思考要怎么弄才能提取单个A位置分子
xf师姐补充信息:提取官能团等信息,用contcar里的A位分子的原子坐标信息提取特征,极化率为预测量
晚上给ppt写了稿子(写在备注里总共九百多字...希望算是正常总之之后得多念几遍
今天中午和死麦一起去了金谷园发现意外地人不是那么多(所以之后可以多去去
(srds之前立的一周不要天天来泡汤了stO就算是下周跑路去深圳的调休好了
3.24 今天正常早起了!
一整天都在折腾机器学习那个东西...总算是看到了希望(但偶极矩算出来都是0...明天再调
(又是三个及以上程序联合工作...要死了
下午去问了一下老师:MTP势接下来做层错、孪晶等缺陷相关(以及之前GAP势做了不同相相变和融化)
NEB的计算检查了一下发现结构崩了所以暂时停掉了(也算给服务器减轻一点压力x
但是最好周三能够再开始做做...
中期的时间确定了(就是后天所以明天得练习一下
不过明天上午大概要在宿舍洗衣服...打印一份带回去吧(
高通量计算现在纯惨案...巨慢无比(明天一定得和师姐商量下
然后是周四要记得关机!(要停电倒闸...
今晚有麦9.9买10块鸡块的活动所以吃的麦(
3.25 明天是中期答辩所以其实花了不少的时间练习和颓废
因为服务器上有几个跑了超过一天的任务所以先杀一下(
下午刘老师找进来说AIMD跑一下400K的温度试试(以及其他找几个温度挑几个试试?不想算太多...
(又是补写的一天...
3.26 窝活着回来了!也没什么好感动的
上午基本上没做什么别的就为了中期操心了(
里面的人拖了很久导致本来10点10进去变成了10点40(
(然后讲了没多久耻辱下播
下午总算把铁电极化那部分完成了晚上开始做催化的东西(感觉真的像是在加班
中午奖励一下自己吃了两份烤冷面加一份蜜雪冰城(然而烤冷面感觉做得不如之前同一家店的煎饼果子...
仍然是到公园里吃的(不得不说还是晚上比较有感觉)
让窝回忆一下之前都在干嘛来着...总之今天的最后杀了两个跑到1k电子步的任务(
(明天感觉又要弄氧化铝那边了...建个新模型?
3.27 上午来了之后发现爬虫爬完90%之后崩了...窝心态也崩了(并没有
脑子里没有太多做事的感觉...(主要是今晚要关服务器
高通量的重算部分还是慢得不得了(到了晚上没算出来的直接停机了...
下午和晚上都主要在搞gbr勉强算是搞出来了(但是读csv和生成数据的神秘问题还没解决明天还要弄
催化那里的lmdb数据库读不出来令人疑惑(明天也要改
明天服务器重开之后记得弄弄氧化铝!(NEB建不出来新模也可以先搞搞高温一点的AIMD
中午去吃了跷脚牛肉(好少)但味道还可以(晚上本来想去肯德基然后人太多最后去了麦stO
3.28 昨晚睡晚了好困...组会的前半段特别困...
下午xf师姐的特别追加导致基本除了xf师姐的任务啥也没干...
生成数据的神秘问题发现是数据合并的时候类型全部变成object(
催化的数据库能读了但是一条数据都读不到(
下午机房重新开机之后AIMD交了6个能稳定的上去(另外是不是不同位向的得建个模但是反正320核跑不动
组会?什么组会困死了好吧其实就是本来没啥进展(